若是快川绍喜只是与斋藤义龙对立，上杉清定自然不会过於关注美浓一国的內政以及宗教事务，可经过加藤段藏、玄鬼、觉马等轩辕眾上忍们的探查后，发现武田家的旧臣们也有参与三河一向一揆的跡象，甚至还有一小部分人趁机潜回了信浓，意图趁著上杉家调集信浓诸將大举南下之际，於信浓一国煽动国人一揆，妄图恢復武田家的家名。

    鑑於信浓一国大部分的兵力，以及有力武將被清定抽调南下前去协助北条家弹压三河一向一揆，使得眼下的信浓境內並无太多的兵力、人力去搜捕潜入的武田家旧臣。

    为了避免信浓境內爆发国人一揆，以及彻底消除武田家在信浓一国的残存影响力，清定便想到了原先世袭罔替信浓守护职的小笠原家。

    如今的小笠原家家督已是由清定的次男小笠原次郎丸来担任，虽然小笠原次郎丸与清定一同居住於小田原城，但小笠原家的直领、政务皆由二木重高、犬甘政德、赤泽贞经、草间肥前守等家中重臣们负责代管、处理。

    眼下，二木重高、犬甘政德等人追隨中条藤资南下进入三河弹压一向一揆，但赤泽贞经、草间肥前守等小笠原家重臣们仍留守在信浓府中的深志城、村井城、林城等小笠原家治下的重镇要地之中。

    小笠原家与武田家同样是出自清和源氏义光流，最早於文治元年（1185年）在首任鎌仓殿源赖朝的推举下出任信浓守一职。

    到了建武元年（1334年），小笠原宗长、小笠原贞宗父子因追隨足利尊氏討伐鎌仓幕府执权北条家有功，由小笠原贞宗出任信浓守护职。

    而小笠原贞宗是当时整个扶桑数一数二的有名武士，其视力更是有著『千里眼』之称，其弓术还曾获得后醍醐天皇的讚赏，之后还被后醍醐天皇称之为『武士皆应以小笠原为榜样』。

    因此，小笠原贞宗还获得后醍醐天皇许可，在自己的三阶菱家纹之中添加『王』字，以此来向世人宣告获得后醍醐天皇亲口称讚的象徵。

    可最为讽刺的是，小笠原贞宗並没有因获得后醍醐天皇的讚赏，和在家纹之中添加『王』字许可而效忠於朝廷、皇室，反而坚定的站在足利家一方，之后成为足利將军家討伐南朝一方的急先锋。

    建武二年（1335年）七月，隨著北条时行掀起的中先代之乱爆发后，小笠原贞宗虽然被諏访神党打得是损兵折將、丟城失地，连头都抬不起来，但还是坚持到了足利尊氏击败北条时行、收復鎌仓。

    在那之后，小笠原贞宗之孙小笠原长基还在桔梗原之战中，大败南朝方宗良亲王为首的南朝方诸將，重创了信浓一国之中的南朝方势力。

    之后，小笠原一族为了向足利將军家表示忠义之心，便放弃了使用带有『王』字的三阶菱家纹，恢復成原先纯黑三阶菱家纹。

    可以说，只要小笠原家的家纹更改成带有『王』字的三阶菱，便能让小笠原家彻彻底底的改头换面，同时此举还能让上杉家获得千种家、伊势北畠家、浪冈北畠家、南部家等南朝方武家的好感。

    另外，信浓府中小笠原家还是小笠原氏的嫡流，作为阿波小笠原氏的三好家曾经因站在南朝一方，被阿波细川家击败后被迫降服，这才將苗字改为了三好。

    面对现任征夷大將军、武家栋樑的足利义辉，曾有意让前任信浓府中小笠原家家督小笠原长时重返旧领，於信浓一国招揽旧部、煽动国人一揆，藉机削弱上杉家的实力。

    先前，因斋藤义龙为避免自己下克上遭到上杉家的討伐，便没有放任小笠原长时通过美浓之地进入信浓境內。

    可现如今，隨著斋藤义龙的突然暴毙，美浓一国全境可谓是暗流涌动，自然就没有人能阻止小笠原长时途经美浓境內重返信浓旧领了。

    为此，清定可不会对小笠原长时重返信浓旧领之举视而不见听而不闻。

    於是，清定一面下令恢復小笠原家使用带有『王』字的三阶菱家纹，一面派遣多罗尾光俊、玄鬼、觉马三人率御庭番眾甲贺组和轩辕眾一部，共一百名忍者进入信浓伊那郡、筑摩郡、安曇郡等地，加强西信浓诸郡的守备，以防小笠原长时煽动国人一揆。

    比起不识时务的小笠原长时，其长男小笠原长隆就相当的识相。不仅在清定的授意下收上杉次郎丸为养子，还將小笠原流弓马术礼法传授给养子次郎丸。作为回报，清定就將信浓安曇郡岩原城七千石授予小笠原长隆，作为隱居料。

    不过，足利义辉、三好长庆等人还是过於高看小笠原长时的影响力和人望了。

    起初，小笠原长时在进入信浓伊那郡境內最先造访的便是出自小笠原家分支的下条家。

    此时的下条家並没有被清定要求，与中条藤资一同出兵前往三河协助北条家弹压一向一揆。

    小笠原长时自认为自己与武田家交锋之际，下条家也出兵支持过自己，便打算先说服下条家与自己一同向上杉家举起反旗，而后再调略筑摩郡、安曇郡两郡的小笠原家重臣赤泽贞经、草间肥前