谋长朱国英（朱九），任海军都督同知，授正四品明威将军衔；原海军副参谋长朱海鸥（朱九十二），任海军都督参谋长，授正五品武德将军衔。

    废除海战卫编制，改为两支舰队，与都司平级。东海舰队以大沽口、威海、松江、福州为主要锚地，治所松江港，下辖12艘秦级战舰和10艘武装货船。

    原海战卫千户沙桐，绰号老鲨鱼，任东海舰队都指挥使，授从四品宣武将军衔。原海军参谋陶大翔（朱七十二），任东海舰队都参谋长，授正六品昭信校尉衔。

    南洋舰队以博寮洲、岘港、马尼拉港为主要锚地，治所岘港，下辖20艘秦级战舰和12艘武装货船。

    原海战卫指挥使黄南平，任南洋舰队都指挥使，授正三品昭勇将军衔。原海军参谋王远景（朱七十），任南洋舰队都参谋长，授正六品昭信校尉衔。