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肖宿坐在第一排正中间,心情却不象万汇杨那么激动。
这些对目前行业来说几乎是顶尖的技术,在他看来,需要优化的地方还有很多。
万汇杨在上面讲的时候,他已经把资料从头到尾看完了。
数据倒没什么问题,GeoSculpt的架构设计也基本沿用了他在论文里铺好的路线。
但有几个地方,他在看的时候习惯性地在脑子里跑了一遍优化方案,觉得还能再调一调。
比如分子对称群自适应分解模块,目前的实现是根据分子类型查表匹配点群。
这个方法对常见分子是够用的,但如果遇到一个全新的、不在表里的分子结构,就需要人工判断对称群。
如果能把这个过程自动化,让小智来做分子对称性识别,速度至少能再提百分之二十。
小智的解耦率目前已经在恒科的机器人、手机和车载系统上跑了快一个月了,处理这种结构化信息的模式识别应该更快一些。
再比如鞍点搜索那部分,万汇杨他们用的是他在NS方程论文里写的鞍点圆法基础版本。
但是基础版本有一个小问题,那就是它在处理多鞍点耦合体系的时候,搜索路径之间偶尔会发生串扰,导致个别鞍点的收敛速度慢下来。
这个问题他后来在整理NS方程十篇系列论文的时候已经找到了解决方案,只是还没单独写到计算化学的应用里。
如果把这部分补上,多鞍点体系的收敛效率应该还能再上一个台阶。
报告厅里的掌声还在持续,提问环节已经开始了。
万汇杨正在回答一个来自辉泽制药研发总监关于蛋白质大分子计算精度的问题,台下不断有人举手。
高长安往旁边看了一眼,发现罗氏的总监正朝这边走过来,手里还拿着名片。
在这种场合,如果让肖宿被人群围住,那今天下午就不用做任何事了。
他几乎是在瞬间就做出了撤退的判断。
他在肖宿耳边低声说了一句。
肖宿没有回头看那些正在涌过来的人群,只点了点头,站起身来。
顾清尘也同时起身,三人在人群合围之前穿过侧面那扇不起眼的安全信道,从报告厅的侧门安静地撤了出去。
苏菲走到第一排的时候,标着肖宿名牌的座位上已经空了,只剩下那份翻完的发布会资料搁在桌上上。
她看了看那个空位,又看了看侧门的方向,有些无奈地笑了一下,把名片收回了口袋里。
化学所三楼实验室里,几台工作站正安静地跑着新的测试数据,机箱风扇发出均匀的白噪音。
通过玻璃能看到楼下报告厅门口还没散去的人群,三三两两的代表还在讨论刚才的数据,记者们正扛着摄象机在采访出场的教授们。
许铭推开实验室的门,引着肖宿走到中间那台工作站前面。
屏幕上正显示着GeoSculpt的运行界面,一个苯分子的基态电子结构计算结果静静地停在上面,旁边的日志窗口滚动着鞍点搜索的迭代记录。
“目前整个框架的内核算法已经稳定了,学术免费版上线之后,下载量几分钟就破千了,服务器的压力测试我们在发布前也已经做过一轮了,暂时还没崩。
但有几个地方,我们一直觉得还能再优化,就是还没找到具体的切入点。”
许铭用手指着屏幕上的架构图,从辛几何映射引擎一路划到鞍点搜索优化器,在架构图上标出了两个红色标记点。
第一个是分子对称性识别模块,第二个是多鞍点耦合体系的收敛稳定性。
肖宿看了一眼那两个标记点,跟他刚才在台下看资料时脑子里跑过的方向一致。
他往前走了两步,手指在第一个标记点上点了点。
“对称性识别这部分,你们目前用的是查表法吧。”
许铭点头:“对,常见分子的点群我们是预先建了表,苯匹配D6h,水匹配C2v,氨匹配C3v,但遇到不在表里的新分子,就只能靠人工判断。”
“查表法对常见的分子够用了,”肖宿说,“但是那些表里没有的结构,每遇到一个新分子就要停下来等人眼判断,自动化流程在这里就断了。”
他走到白板前,拿起马克笔,在上面画了一个简单的分子结构草图,旁边标注了它的对称元素。
“分子点群的自动识别本质上是一个有限几何判定问题。
对称操作在笛卡尔坐标系下可以表示成一组三乘三的矩阵,矩阵的迹和行列式决定了操作的类型。
只需要扫描这个分子的所有对称操作,先找主轴,主轴方向取最高重旋转轴,再找垂直于主轴的C2轴,然后判断镜面和反演中心的有无,最后根据这些对称元素的组合关系就能
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